יערות, שדות, כרי דשא, ביצות ואגמים הם דוגמאות למערכות אקולוגיות טבעיות, או ביוג'נוזוזות. יש להם תנאים סביבתיים אחידים יחסית והם נוצרים על ידי אוכלוסיות שונות של אורגניזמים חיים החיים יחד ומתקשרים זה עם זה ועם הטבע הדומם. בנוסף, מערכות אקולוגיות נתונות להתערבות אנושית.
במערכת האקולוגית, קהילת היצורים החיים, יחד עם הסביבה הפיזית של בית הגידול שלהם, מתפקדת כולה. אגמים נחשבים לגופי מים טבעיים עם מים עומדים הנמצאים בשקעים של הארץ. הם זורמים ונטולי ניקוז, טריים ומלוחים. אגם ביוג'נוזוזיס מורכב מהאורגניזמים המאכלסים את גוף המים, את התכונות הפיזיקליות והכימיות של מים, את המאפיינים של הטופוגרפיה התחתונה, הרכבם ומבנה האדמה. המערכת האקולוגית מושפעת גם מהאוויר האטמוספרי, העוסק במגע עם פני המים, קרינת השמש וגורמים אחרים. יותר ויותר משקל צובר השפעה מצד האדם. אנשים יכולים להשתמש במערכות אקולוגיות של אגם בדרכים שונות. האפשרות הוותיקה ביותר להפעלת אגמים היא דיג, מכיוון שעצם המבנה של ביוג'וזנוזות האגם מעדיף גידול ודיג. אתה יכול לגדל לא רק דגים, אלא גם אצות, ואורגניזמים אחרים המשמשים אז בבישול, פרמקולוגיה ואזורים אחרים במשק הלאומי. האדם משתמש במי אגם כדי להשקות בעלי חיים, להשקות צמחים ולמטרות ביתיות. הבוצה הפורייה המופקת מקרקעית האגם יכולה לשמש כדשן בחקלאות. מכיוון ששרידי צמחים ובעלי חיים נרקבים זה מאות שנים, הוא מזין במיוחד. דשן טבעי זה עולה על האיכות של רוב האנלוגים הכימיים המלאכותיים. בריכות ושטחי הסביבה משמשים בני אדם לבילוי ופנאי, תיירות וספורט. אגמים גדולים יכולים לשמש גם כנתיבי תחבורה המחברים בין נקודות שונות ביבשה. למרות העובדה שביוגיאוזנוזיס יציבה יחסית לאורך זמן והיא מערכת המווסתת את עצמה ושומרת על עצמה, היא יכולה לעבור שינויים משמעותיים, עד המעבר לסוג אחר של קהילה אקולוגית. כך, בנסיבות מסוימות, האגם יכול לצמוח ולהפוך לביצה. זה קורה כאשר המקטינים (אורגניזמים המעבדים פסולת) מפסיקים להתמודד עם הנטל המוטל עליהם. במקביל, הרכב המינים של התושבים ומאפייני המאגר משתנים. באופן טבעי, האדם כבר לא יכול לנצל את הביצה כמו אגם שהיה בעבר. באמצעות מערכות אקולוגיות של אגם, אנשים צריכים להיות מודעים להשלכות הסביבתיות שמניפולציה זו או אחרת יכולה להוביל לה. לצורך ניהול טבע רציונאלי יש צורך להכיר את המבנים ואת מנגנוני התפקוד של קהילות טבע.
